È nominato nella persona del Sindaco pro-tempore del Comune di San Giovanni Ilarione e rimane in carica per cinque anni. Alla scadenza del termine di cinque anni il Presidente è nominato dal Fondatore Comune di San Giovanni Ilarione e dura in carica 5 anni.
Rappresenta legalmente la Fondazione
Il Presidente esercita esclusivamente poteri di indirizzo, promuove le relazioni con Enti, Istituzioni, soggetti anche imprenditoriali pubblici o privati ed ogni altro organismo anche estero o sovranazionale, al fine di instaurare rapporti di collaborazione a sostegno delle singole iniziative della Fondazione stessa.
Più in particolare il Presidente:
a) convoca il Consiglio di Indirizzo;
b) convoca l'Assemblea dei Partecipanti, se costituita.